2020年5月，元谋县检察院对履职中发现元谋人遗址存在保护管理不到位的情形，向两家行政机关制发检察建议书，督促其依法履行职责。行政机关及时进行整改，增聘元谋人遗址管护人员3名，加强人员力量并强化管理培训；更换、修复毁损的103棵界桩及铁丝网；常态化将消防水池蓄满水，保障消防用水；对遗址保护区内13冢坟墓进行迁出；在遗址保护区重要位置制作、树立了9块文物保护公告警示牌，在周边村组召开文物保护宣讲大会，营造好文物保护人人有责的良好氛围，元谋人遗址得到了有效保护。

元谋县检察院在总结经验的基础上，开展了“文物和文化遗产”公益诉讼专项监督行动。2020年以来，元谋县检察院组织干警对全县70余处文物保护单位进行走访调查，针对文物保护单位普遍存在的未设立文物保护标识、监管保护不到位、保护设施建设不全等问题进行排查、监督，制发检察建议15份，推动各责任单位对存在问题进行整改，进一步规范文物和文化遗产管理保护工作。

2023年1月，元谋县检察院、元谋县文化和旅游局会商制定了《关于建立加强元谋人遗址公益保护协作工作实施方案》，并在元谋人遗址保护区挂牌设立“元谋人遗址公益保护示范点”，充分发挥检察机关法律监督职能，探索建立“检察公益保护+行政监管＋遗址管理”三位一体的公益司法保护新模式。同时，进一步压实责任，强化组织领导，成立“元谋县人民检察院元谋人遗址公益保护领导小组”，凝聚四大检察合力，综合运用打击、保护、监督、预防、教育等手段，加强元谋人遗址周边环境等外部妨害排除，严惩妨害遗址保护的违法犯罪行为，切实推进元谋人遗址保护。